生物信息广泛涵盖基因组学、蛋白组学、系统生物学、表观遗传、非编码等前沿领域以及药物设计、基因工程等应用领域。与传统的理论和实验学科不同，生物信息是一门数据科学，这就需要从业者具备一定数据收集、管理、处理和分析的能力。随着高通量测序以及生物信息学的发展，R 语言在生物大数据分析以及数据挖掘中发挥着越来越重要的作用。R 语言不仅可以完成生物大数据的统计工作，同时可以进行高质量的绘图，在CNS 等顶级杂志发表的诸多文章中，不管是复杂的统计分析还是精美的制表绘图，R 都可以轻松完成。R 语言的Bioconductor 项目是专门为生物数据分析而设立的，Bioconductor 包含了很多生物分析项目一整套完整分析方案，例如GEO 数据，RNAseq 数据等，可以完成数据评估，过滤，比对，统计分析，注释，聚类，系统发育分析等等工作。为了帮助生命科学研究工作者对生物数据的分析挖掘工作，我们举办了本次R 语言与生物信息学培训班，本次会议我们精选大量生物数据分析案例，包括利用R 语言绘制SCI 级别文献图，以及结合一个完整的利用R 语言分析RNAseq 数据的案例。通过本次培训，各位老师能够掌握利用R 科学文献图的绘制以及完整的利用R 分析生物数据的过程，助力科研，提高研究论文发表的层次。
一、时间地点
时间：2018 年11月26—28日
地点：大发体育生命科学学院南山6号楼B610
二、培训目标
1.熟悉R 语言及Bioconductor 项目；
2.掌握生物信息学领域R 语言操作方法；
3.掌握多种科学文献图的绘制；
4.掌握利用R 语言分析RNAseq 数据流程；
5.能独立编写和调试小程序；能熟练使用函数和模块；
6.掌握R语言数据可视化工具及其科学准确解译；
7.了解R语言强大的可扩展性和应用广度。
三、主讲专家
孔秋生 教授 （华中农业大学园艺学院/石河子大学教授）
郭长帅 博士 （石河子大学教授）
主讲专家长期从事生物统计、生物信息分析，基因测序等领域工作研究工作，精通R 语言、SAS、SPSS 等分析工具，具有丰富的科研及项目工作经验。主要研究方向：生物信息学，系统生物学，宏基因组学、转录组、代谢组、蛋白组等组学、蛋白质网络、可变剪切、分子进化等。从事R语言的研发和教学，经验丰富。
四、培训对象
各学院从事生物、遗传、基因、环境、农业、医药、生态、微生物等专业数据统计分析的技术骨干、相关专业教学人员及在校研究生、硕士、博士等相关人员。
五、培训方式
1.课程讲座
2.专题小组研讨与案例讲解分析结合
3.上机操作实训。
六、课程安排
| 日期
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时间
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授课内容
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地点
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| 11月26日
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8:00-11:30
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1.R&Rstudio安装
2.程序包、函数和帮助系统
3.数据类型
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6号楼B610
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| 14:30-17:30
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1.R作图基础
2.数据类型与图形选择
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6号楼B610
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| 11月27日
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8:00-11:30
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1.ggplot2语法
2.ggplot2作图应用
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6号楼B610
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| 14:30-17:30
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1.t测验及作图
2.方差分析及作图
3.相关回归分析及作图
4.卡方测验
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6号楼B610
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| 11月28日
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8:00-11:30
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1.聚类分析
2.主成分分析
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6号楼B610
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| 14:30-17:30
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1.Bioconductor简介
2.RNAseq数据分析实践
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6号楼B610
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