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学术培训：高阶多元统计与生物信息学应用实战培训—R语言培训

发布日期：2018-11-20 来源部门：生命科学学院点击次数：

　　生物信息广泛涵盖基因组学、蛋白组学、系统生物学、表观遗传、非编码等前沿领域以及药物设计、基因工程等应用领域。与传统的理论和实验学科不同，生物信息是一门数据科学，这就需要从业者具备一定数据收集、管理、处理和分析的能力。随着高通量测序以及生物信息学的发展，R 语言在生物大数据分析以及数据挖掘中发挥着越来越重要的作用。R 语言不仅可以完成生物大数据的统计工作，同时可以进行高质量的绘图，在CNS 等顶级杂志发表的诸多文章中，不管是复杂的统计分析还是精美的制表绘图，R 都可以轻松完成。R 语言的Bioconductor 项目是专门为生物数据分析而设立的，Bioconductor 包含了很多生物分析项目一整套完整分析方案，例如GEO 数据，RNAseq 数据等，可以完成数据评估，过滤，比对，统计分析，注释，聚类，系统发育分析等等工作。为了帮助生命科学研究工作者对生物数据的分析挖掘工作，我们举办了本次R 语言与生物信息学培训班，本次会议我们精选大量生物数据分析案例，包括利用R 语言绘制SCI 级别文献图，以及结合一个完整的利用R 语言分析RNAseq 数据的案例。通过本次培训，各位老师能够掌握利用R 科学文献图的绘制以及完整的利用R 分析生物数据的过程，助力科研，提高研究论文发表的层次。

　　一、时间地点

　　时间：2018 年11月26—28日

　　地点：大发体育生命科学学院南山6号楼B610

　　二、培训目标

　　1.熟悉R 语言及Bioconductor 项目；

　　2.掌握生物信息学领域R 语言操作方法；

　　3.掌握多种科学文献图的绘制；

　　4.掌握利用R 语言分析RNAseq 数据流程；

　　5.能独立编写和调试小程序；能熟练使用函数和模块；

　　6.掌握R语言数据可视化工具及其科学准确解译；

　　7.了解R语言强大的可扩展性和应用广度。

　　三、主讲专家

　　孔秋生教授（华中农业大学园艺学院/石河子大学教授）

　　郭长帅博士（石河子大学教授）

　　主讲专家长期从事生物统计、生物信息分析，基因测序等领域工作研究工作，精通R 语言、SAS、SPSS 等分析工具，具有丰富的科研及项目工作经验。主要研究方向：生物信息学，系统生物学，宏基因组学、转录组、代谢组、蛋白组等组学、蛋白质网络、可变剪切、分子进化等。从事R语言的研发和教学，经验丰富。

　　四、培训对象

各学院从事生物、遗传、基因、环境、农业、医药、生态、微生物等专业数据统计分析的技术骨干、相关专业教学人员及在校研究生、硕士、博士等相关人员。

　　五、培训方式

　　1.课程讲座

　　2.专题小组研讨与案例讲解分析结合

　　3.上机操作实训。

　　六、课程安排

日期	时间	授课内容	地点
11月26日	8:00-11:30	1.R&Rstudio安装 2.程序包、函数和帮助系统 3.数据类型	6号楼B610
11月26日	14:30-17:30	1.R作图基础 2.数据类型与图形选择	6号楼B610
11月27日	8:00-11:30	1.ggplot2语法 2.ggplot2作图应用	6号楼B610
11月27日	14:30-17:30	1.t测验及作图 2.方差分析及作图 3.相关回归分析及作图 4.卡方测验	6号楼B610
11月28日	8:00-11:30	1.聚类分析 2.主成分分析	6号楼B610
11月28日	14:30-17:30	1.Bioconductor简介 2.RNAseq数据分析实践	6号楼B610